Только после того, как всех приговоренных к смертной казни расставили на эшафоте для приведения приговора в исполнение, было объявлено повеление Николая I о замене расстрела другими наказаниями.

В конце 1876 г. в Петербурге возникла народническая организация «Земля и воля». В Петропавловской крепости находились М. А. Натансон, А. Ф. Михайлов, Ф. В. Трощинский и др.

В 1879 г. в результате раскола «Земли и воли» возникла новая тайная организация народников — «Народная воля» (в нее входили М. Ф. Фроленко, В. Н. Фигнер, С. Л. Перовская, А. Н. Желябов, A. Д. Михайлов и др.).

В Секретном доме Алексеевского равелина с 1851 по 1854 г. находился один из идеологов народничества М. А. Бакунин. Он попал в Петропавловскую крепость после приговора его к смертной казни судами двух зарубежных государств и заточения в нескольких тюрьмах за пределами России. В 1860–1880 гг. в Петропавловскую крепость были помещены члены народнических организаций «Земля и воля» и «Народная воля» — Д. М. Рогачев, А. Д. Михайлов, А. Н. Желябов, B. Н. Фигнер и др.

Особым присутствием Правительствующего Сената 29 марта 1881 г. было рассмотрено дело об убийстве Александра II. К смертной казни приговорены шесть обвиняемых. При этом Желябов, Перовская, Кибальчич, Михайлов, Рысаков были повешены, а Гельман — умерла в тюремной больнице. До приведения приговора в исполнение осужденные к смертной казни содержались в тюрьме Третьего отделения, Трубецком бастионе Петропавловской крепости и в доме предварительного заключения.

Из осужденных по этому процессу до перевода в Шлиссельбургскую крепость (с 1880 по 1884 г.) умерли С. Г. Ширяев, Л. Д. Терентьева, А. Д. Михайлов, М. Р. Ланганс, А. Н. Баранников.

Будучи возмущена действиями градоначальника Санкт-Петербурга генерала Трепова, отдавшего распоряжение о применении физического наказания (избиения розгами) к политическому заключенному Боголюбову, осужденному к каторжным работам за участие в манифестации молодежи у Казанского собора, 24 января 1878 г. революционерка Вера Засулич выстрелом из пистолета большого калибра с близкого расстояния нанесла Трепову «рану в области таза».

На судебном процессе по обвинению Засулич председательствовал известный российский юрист А. Ф. Кони. Суд присяжных вынес вердикт — оправдать[104].

Вера Засулич содержалась не только в Доме предварительного заключения, но и в Петропавловской крепости, в которую ее поместили в начале 1870-х гг. по обвинению в политической пропаганде.

Кстати сказать, оправдательный приговор был все же отменен, однако обвиняемая уже скрылась за границу. Повторного рассмотрения дела Засулич не произошло, так как вызванная на новое судебное рассмотрение обвиняемая, находившаяся в Швейцарии, в суд так и не явилась.

В 1887 г. в Петропавловскую крепость были заключены члены террористической фракции «Народной воли». Они обвинялись в подготовке покушения на Александра III, в том числе А. И. Ульянов.

В 1879 г. узником Петропавловской крепости стал один из создателей первой самостоятельной рабочей организации Петербурга В. И. Обнорский. Организация, созданная им и С. Н. Халтуриным, носила название «Северный союз русских рабочих».