Секретариат НКГБ СССР — (В.А Голованов).
Тогда же в феврале 1941 года Особый отдел ГУГБ НКВД СССР был расформирован, а вместо него были созданы: 3 управление Наркомата обороны (НКО) СССР и Наркомата военно-морского флота (НК ВМФ) и 3 отдел НКВД СССР (по оперативной работе в войсках НКВД), куда и были переданы функции бывшего Особого отдела бывшего ГУГБ НКВД СССР. Начальником 3 отдела НКВД СССР был назначен А.М.Белянов. Начальником 3 управления НКО СССР стал бывший начальник ОО ГУГБ НКВД СССР А.И.Михеев, начальником 3 управления НК ВМФ был назначен бывший начальник 10 отделения ОО ГУГБ НКВД СССР Петров А.И.
Приказом НКВД СССР № 00198 от 22 февраля 1941 г. для ведения шифрованной переписки НКВД СССР было организовано 6 отделение НКВД СССР. Начальником 6 отделения НКВД СССР был назначен А.А.Солодянников.
26 февраля 1941 г. была объявлена новая структура НКВД СССР:
Руководство НКВД СССР:
Л.П.Берия — нарком внутренних дел СССР;
СН.Круглов — 1 зам. НКВД СССР;
В.С.Абакумов — зам. НКВД СССР;
В.В.Чернышов — зам. НКВД СССР;
И.И.Масленников — зам. НКВД СССР по войскам;
Б.П.Обручников — зам. НКВД СССР по кадрам.
Главное управление милиции (ГУМ) — (А.Г.Галкин);
Главное управление пожарной охраны (ГУПО) — (Е.В.Козик);
Главное управление местной противовоздушной обороны (ГУМПВО) — (В.В.Осокин);
Главное архивное управление (ГАУ) — (И.И.Никитинский);
Тюремное управление — (М.И.Никольский);
Управление по военнопленным и интернированным (УПВИ) — (П.К.Сопруненко);
Главное управление погранвойск (ГУПВ) — (Г.Г.Соколов);
Главное управление войск НКВД СССР по охране ж.д. сооружений и особо важных предприятий промышленности — (А.И.Гульев);
Управление оперативных войск — (П.А.Артемьев);
Управление конвойных войск — (В.М.Шарапов);
Управление агитации и пропаганды войск НКВД — (П.Н.Мироненко);
Управление военного снабжения войск НКВД — (А.А.Вургафт);
Военно-строительный отдел — (И.С.Любый);
3 отдел НКВД СССР — (А.М.Белянов);
ГУЛАГ — (В.Г.Наседкин);
Главное управление лагерей ж.д. строительства (ГУЛЖДС) — (Н.А.Френкель);
Главгидрострой — (Я.Д.Рапопорт);
Главное управление лагерей горно-металлургических предприятий — (П.А.Захаров);
Главпромстрой — (Г.М.Орлов);
Управление лагерей топливной промышленности — (С.Н.Бурдаков);
Управление лагерей лесной промышленности — (М.М.Тимофеев);
Управление лагерей по строительству Куйбышевских заводов — (А.П.Лепилов);
Главное управление строительства на Дальнем Севере (ГУСДС) "Дальстрой" — (И.Ф.Никишов);
ГУШОСДОР — (В.Т.Федоров);
Административно-хозяйственное управление (АХУ) — (Ю.Д.Сумбатов);
Управление технического снабжения строек и лагерей — (В.А.Поддубко);
Отдел кадров — (Б.П.Обручников);
Центральный финансово-плановый отдел (ЦФПО) — (Л.И.Берензон);
Отдел ж.д. и водных перевозок — (С.И.Зикеев);
Моботдел — (И.С.Шередега);
Отдел госхранилища — (В.Н.Владимиров);
Особое техбюро (ОТБ) при НКВД СССР — (В.А.Кравченко);
Секретариат Особого совещания (ОСО) — (В.В.Иванов);
Контрольно-инспекторская группа при НКВД СССР — (Н.И.Павлов);
Секретариат НКВД СССР — (С.С.Мамулов);
Горнотехническая инспекция — (П.В.Марков);