24 октября 1941 г. Главгидрострой НКВД СССР был расформирован, а в составе Главпромстроя (ГУЛПС) НКВД СССР был создан Отдел гидротехнических работ при штате сотрудников в 35 человек. Бывший начальник Главгидростроя НКВД СССР Я.Д.Рапопорт был назначен заместителем начальника ГУЛПС НКВД СССР, а начальником Отдела гидротехнических работ ГУЛПС НКВД СССР был назначен бывший зам. начальника Главгидростроя НКВД СССР С.Я.Жук.
Приказом НКВД СССР № 001702 от 19 ноября 1941 г. Моботдел НКВД СССР был упразднен.
Приказом НКВД СССР № 001613 от 21 ноября 1941 г. было объявлено постановление ГКО № 903сс от 17 ноября 1941 г. о предоставлении Особому совещанию НКВД СССР права выносить меры наказания по возникающим в органах НКВД делам о контрреволюционных преступлениях и особо опасных преступлениях против порядка управления СССР вплоть до расстрела. Указанное постановление ГКО не было отменено вплоть до 1 сентября 1953 г., когда указом ПВС СССР Особое совещание МВД СССР было упразднено.
Интересно отметить, что центральный аппарат НКВД СССР в 1941 г. обслуживали 682 автомашины, из них 52 грузовые и 12 спецмашин (автозаки) 1 с/о НКВД СССР, которые размещались на трех автобазах Автотехнического отдела ХОЗУ НКВД СССР: автобаза № 1 (легковая) — Варсанофьевский переулок, дом 9; автобаза № 2 (легковая) — Сущевский вал, 33; автобаза № 3 (грузовая) — улица Зоологическая, 26.
Наркома внутренних дел СССР Л.П.Берия обслуживали два "Кадиллака" и "Бьюик", первого заместителя НКВД СССР В.Н.Меркулова обслуживали два "Бьюика" и "Додж". Парк легковых автомобилей состоял также из автомобилей таких марок, как: "Паккард", "Мерседес", "Гудзон", "Линкольн", "Форд", "Шевроле", "Крейслер", "Шкода", а также из отечественных: ЗИС-101 и М-1.
В 1941 г. основные управления и отделы центрального аппарата НКВД СССР размещались на улице Дзержинского в доме № 2, а также: ГУЛАГ и другие лагерные управления размещались в доме № 3 по улице Кирова, на улице Дзержинского в домах № № 12 и 13 и на Покровском бульваре в доме № 14; ГУ АС размещался на улице Куйбышева в доме № 8; Главное управление милиции размещалось на улице Чкалова в домах №№ 30 и 36, в доме № 5/12 по Фуркасовскому переулку, в доме № 25 на Садово-Сухаревской улице и в доме № 242 по Ленинградскому шоссе. Главное архивное управление размещалось в доме № 17 по Большой Пироговской улице.
Отметим также, что центральный аппарат НКВД СССР в 1941 г. обслуживали следующие тюрьмы центрального подчинения, расположенные в городе Москве:
Внутренняя тюрьма НКВД СССР (емкость — 570 мест, штат — 308 сотрудников, начальник тюрьмы — капитан гб А.Н.Миронов);
Бутырская тюрьма НКВД СССР (емкость — 3500 мест, штат — 1184 сотрудника, начальник тюрьмы — майор гб А.Л.Пустынский);
Лефортовская тюрьма НКВД СССР (емкость — 625 мест, штат — 315 сотрудников, начальник тюрьмы — капитан гб И.Ф.Ивашко);
Сухановская тюрьма НКВД СССР (емкость — 225 мест, штат — 161 сотрудник, начальник тюрьмы — лейтенант гб Г.Е.Ионов).
1942 ГОД
Совместным приказом НКВД и НК ВМФ СССР 11 января 1942 г. 3 управление НК ВМФ было преобразовано в отдел морской контрразведки в составе УОО НКВД СССР.