ГУШОСДОР (920 человек, — В.Т.Федоров);

ЦОАГС — (Ф.М.Солодов);

УКМК (1466 человек, — Н.К.Спиридонов);

ГУПВ (552 человека, — Г.Г.Соколов);

Главное управление войск НКВД по охране ж.д. сооружений (180 человек, — А.И.Гульев);

Главное управление конвойных войск НКВД (137 человек, — В.М.Шарапов);

Главное управление войск НКВД по охране промпредприятий (141 человек, — Е.В.Козик);

ГУВС (761 человек, — ААВургафт);

ГВСУ (134 человека, — И.С.Любый);

УПВИ (56 человек, — П.К.Сопруненко);

Центральный совет спортивного общества "Динамо" (126 человек);

Московское управление Дальстроя (117 человек);

Центральный клуб сотрудников НКВД СССР (158 человек, — Е.В.Шалыт).

Всего на 1 января 1940 г. по центральному аппарату по штатам числилось 32642 человека.

В 1940 году произошли следующие изменения в структуре НКВД СССР:

4 января 1940 г. на базе Отдела ж.д. строительства ГУЛАГа и Управления ж.д. строительства на Дальнем Востоке было образовано Главное управление лагерей ж.д. строительства (ГУЛЖДС) НКВД СССР. Его начальником был назначен НАФренкель.

Приказом НКВД СССР № 001013 от 17 августа 1940 г. в составе НКВД СССР было сформировано Главное управление политпропаганды войск НКВД СССР. Начальником этого главка был назначен дивизионный комиссар П.Н.Мироненко.

28 августа 1940 г. для руководства строительством авиационных заводов в Куйбышевской области было образовано Управление особого строительства (Особстрой) НКВД СССР во главе с заместителем начальника ГУЛАГа НКВД СССР А.П.Лепиловым.

13 сентября 1940 г. на базе Гидротехнического отдела ГУЛАГа было образовано Главное управление гидротехнического строительства (Главгидрострой) НКВД СССР во главе с Я.Д.Рапопортом.

29 октября 1940 г. в составе НКВД СССР было организовано Главное управление местной противовоздушной обороны (ГУМПВО) НКВД СССР во главе с В.В.Осокиным.

Указом ПВС СССР от 3 февраля 1941 г. НКВД СССР был разделен на два наркомата: НКВД СССР и НКГБ СССР наркомом внутренних дел СССР был назначен Л.П.Берия, а наркомом государственной безопасности СССР — В.Н.Меркулов.

3 февраля 1941 г. Л.П.Берия был также назначен заместителем председателя СНК СССР по совместительству, где ему поручили курировать работу НКВД, НКГБ, НКлеспрома, НКцветмета, НКнефтепрома, и НКречфлота.

Структура образованного НКГБ СССР быта следующей:

Руководство НКГБ СССР:

В.Н.Меркулов — нарком государственной безопасности СССР;

И.А.Серов — 1 зам. НКГБ СССР;

Б.З.Кобулов — зам. НКГБ СССР;

М.В.Грибов — зам. НКГБ СССР по кадрам.

1 управление (разведка за границей) — (П.М.Фитин);

2 управление (контрразведка) — (П.В.Федотов);

3 управление (секретно-политическое) — (С.Р.Мильштейн);

Следчасть (на правах управления) — (Л.Е.Влодзимирский);

УКМК — (Н.К.Спиридонов);

1 отдел (охрана правительства) — (Н.С.Власик);

2 отдел (учетно-статистический) — (Л.Ф.Баштаков);

3 отдел (обыски, аресты, наружное наблюдение) — (Д.Н.Шадрин);

4 отдел (опертехники) — (Е.П.Лапшин);

5 отдел (шифровальный) — (А.И.Копытцев);

Отдел кадров — (М.В.Грибов);

Административно-хозяйственный и финансовый отдел (АХФО) — (А.М.Давыдов);