В марте 2007 г. немецкий парламент одобрил решение правительства об участии разведывательной авиационной группы в составе международных сил содействия безопасности ISAF – войскового контингента в Афганистане, возглавляемого НАТО. Речь шла о шести самолетах «Торнадо» и наземного персонала 51-й эскадры, которые были переброшены на аэродром в Мазари Шариф и с апреля 2007 г. начали выполнять разведывательные полеты над Афганистаном.

Афганская миссия германских «Торнадо» продолжалась 1335 дней и была завершена 27 ноября 2010 г. В этот период в составе экипажей в Афганистане побывало 69 летчиков и 54 офицера управления вооружением. Было совершено 4508 разведывательных вылетов, а общий налет составил 8107 ч. Смена экипажей была на ротационной основе, составлявшей 6 недель и более. В ходе каждой такой ротации в Афганистан прибывало 2 молодых экипажа, получавших боевую закалку.

В настоящее время все самолеты в варианте ECR уже прошли модернизацию по программе ASSTA 3.0. В ходе нее самолеты были оснащены новыми дисплеями в кабине экипажа, новым разведывательным оборудованием, размещенным в хвостовой части. Самолеты также получили новые радары и были оснащены новой цифровой линией передачи данных LINK-16.

Появление БПЛА в германских ВВС значительно повысило их боевой потенциал. Большие надежды возлагались на программу «Еврохок» по оснащению Бундеслюфтваффе европейской версией американских БПЛА RQ-4B «Глоубал Хок» компании «Нортроп Грумман». 5 февраля 2010 г. в Ягеле для этих целей была сформирована вторая эскадрилья. На аэродроме была построена вся необходимая для этих целей инфраструктура, а наземный персонал прошел необходимое обучение и подготовку на территории США.

Однако немецкий бюджет оказался не готов нести огромные затраты в рамках программы «Еврохок». Масло в огонь еще подлило скандальное видео, просочившееся в Интернет в 2013 г. На видео, датированном 2004 г. и тщательно до этого скрывавшимся, было хорошо видно, как немецкий беспилотник едва не столкнулся с пассажирским лайнером А-300 в небе Афганистана. Службы управления воздушным движением в Германии были категорически против появления в небе таких дронов. «Еврохоки» было необходимо дорабатывать и оснащать системой о предупреждении столкновения в воздухе. Дорогостоящие расходы Германия нести отказалась и в конце 2013 г. объявила об окончательном выходе из программы.

Однако немцы все же не отказались от БПЛА. В 2010 г. в Израиле были закуплены беспилотники «Херон-1», сразу же оправившиеся в Мазари Шариф на смену истребителям «Торнадо», покидавшим Афганистан. В настоящее время вторая эскадрилья 51-го авиакрыла полностью боеготова. В планах германского командования входят закупки другого американского БПЛА MQ-1 «Предейтер», которые должны будут базироваться в Ягеле.

Оснащение эскадры AG 51 принципиально новыми боевыми системами не означает постепенный отход от эксплуатации истребителей «Торнадо». Наоборот, в такой совокупности это значительно повышает боевые возможности авиакрыла AG 51 «Иммельман».