В 1990 году на вооружение принимается модернизированный вариант комплекса «Тунгуска-М» (2К22М). В отличие от «Тунгуски» на ней были установлены новые радиостанции и приемник для связи с УБКП «Ранжир» (ПУ-12М) и ППРУ-1М (ППРУ-1), а также газотурбинный двигатель агрегата электропитания боевой машины с повышенным до 600 час (вместо 300 час) ресурсом работы.

ЗСУ «Тунгуска-М» в 1990 г. прошла государственные полигонные испытания и в этом же году принята на вооружение.

Дальнейшим этапом модернизации ЗСУ является «Тунгуска-Ml», впервые показанная на оружейной выставке в Абу-Даби в 1995 году и принятая на вооружение в 2003 году. Главными ее отличиями являются: автоматизация процесса наведения ЗУР и обмена информацией с батарейным командирским пунктом, применение новой ракеты 9М311М с радиолокационным взрывателем и импульсной лампой вместо лазерного взрывателя и трассера соответственно. В этом варианте ЗСУ вместо белорусской ГМ-352 используется новая ГМ-5975, созданная производственным объединением (ПО) «Метровагонмаш» в г. Мытищи.

Шасси ГМ-5975 при массе в 23,8 т и предельной нагрузке до 11,5 т обеспечивает движение ЗСУ со скоростью до 65 км/час при среднем удельном давлении на грунт не более 0,8 кг/см2 . База шасси достигает 4605 мм, дорожный просвет – 450 мм. В качестве силовой установки используется многотопливный дизель с жидкостным охлаждением мощностью 522 (710)-618 (840) кВт (л.с.). Запас хода по топливу при полной заправке составляет не менее 500 км. Характеристики шасси обеспечивают его эксплуатацию при температуре окружающего воздуха от -50° до +50°С, относительной влажности воздуха 98% при температуре +35°С и его запыленности в движении до 2,5 г/м3 . На новом шасси установлена микропроцессорная система диагностики и автоматического переключения передач.

Использование указанных и ряда других технических решений позволили:

- повысить общую эффективность боевого применения ЗСУ при отражении массированного налета СВН противника;

- свести к минимуму ошибки в сопровождении скоростной воздушной цели оптическим прицелом, который фактически стал похож на процесс сопровождения неподвижной цели;

- существенно повысить помехозащищенность, с 8 до 10 км дальность и эффективность поражения воздушных целей в условиях интенсивного применения ими оптических помех;

- повысить эффективность стрельбы зенитными пушками за счет повышения точности измерения углов наклона и курса самохода в движении;

- увеличить вероятность поражения крылатых ракет за счет использования радиолокационного взрывателя с круговой диаграммой направленности антенны.

В целом уровень боевой эффективности комплекса «Тунгуска-Ml» в условиях помех в 1,3-1,5 раза выше в сравнении с ЗСУ «Тунгуска-М».

Высокие боевые и эксплуатационные характеристики ЗПРК «Тунгуска» различных модификаций много раз были подтверждены в ходе учений и учебно-боевых стрельб. Комплекс неоднократно демонстрировался на международных выставках оружия и всегда привлекал внимание специалистов и посететителей.

Эти качества позволяют ЗПРК «Тунгуска» сохранять свою конкурентоспособность на мировом рынке вооружений. В настоящее время «Тунгуска» состоит на вооружении армии Индии и других стран, выполняется контракт на поставку этих комплексов в Марокко.