В военном плане крупных боевых действий против ОУН—УПА (до начала 1949 г.) не велось, дело ограничивалось разведкой и расширением агентурной сети. Если же наносились удары, то лишь по верхушке подполья и повстанцев. Особо интересовали чекистов старшины УПА — командиры отделов и групп, повстанческие штабы, пропагандисты, а также подпольные типографии. Для их выявления применялись секретные сотрудники, отдельные террористические отряды по борьбе с подпольем, а также спецгруппы, рейдировавшие под видом повстанцев.

Однако два года (1946–48) такой борьбы с УПА и ОУН без особых успехов позволили партаппарату Хрущева начать критику методов Ковальчука. Это вынудило активизироваться и чекистов. А в 1950–51 гг. они вернулись к старой практике блокад и облав.

В начале 1949 г. по приказу генерал-лейтенанта Ковальчука в Карпаты были переброшены четыре дивизии МГБ для «окончательной ликвидации» УПА и подполья. Но начавшаяся «военно-чекистская операция» принесла СССР только вред — об украинском движении сопротивления узнали на Западе. Внимание журналистов (например, влиятельного обозревателя Г. Болдуина из газеты «Нью-Йорк Таймс») привлекли боевые действия в мирное время.

К другим методам борьбы НКВД—МГБ и НКГБ— МГБ с УПА и подпольем можно отнести создание «случайных точек», перепись населения, введение семейной и имущественной ответственности, публичную демонстрацию силы, а также создание агентурной сети и организацию провокаций. При этом если первые два метода выступали в качестве подготовительных, то три последних непосредственно претворяли теорию в практику.

Создание «случайных точек (баз)» НКВД началось уже весной 1945 г., в разных местах, обычно возле тех лесных массивов, где по данным НКВД могли находиться формирования УПА. Организовывались такие базы неподалеку от населенных пунктов, где устраивались хорошо укрепленные передовые пункты НКВД, имевшие порядка 100–120 человек личного состава. Вооружение и боеприпасы для «точек» доставлялись только в ночное время, часть личного состава ходила в гражданской одежде, выдавая себя за работников и специалистов по вырубке и вывозу леса.

Задачами «случайных точек» было:

— ведение беспрерывной разведки леса и окрестных сел;

— контроль путей из сел в лес и пресечение поставок продовольствия повстанцам;

— беспокойство УПА небольшими акциями;

— налеты на села и проведение малых облав. Перепись населения, проведенная в январе-феврале 1945 г., представлялась как акция советской власти. Однако ее результаты использовались для поиска «чужого элемента», т. е. членов подполья, которые по роду своей деятельности были вынуждены время от времени находиться не в своей местности. Поэтому перепись была, как правило, связана с облавами, кроме того, регистрации подлежало только население в возрасте старше 14 лет.

На все семьи членов УПА НКВД наложило семейную и имущественную ответственность. Это значило, что если власти узнавали, что кто-то находится в УПА, то срочно арестовывали всю его семью и вывозили ее в Сибирь, а имущество конфисковывали.