Например, «с первых дней оккупации западных районов Ленинградской области значительная часть православного духовенства стала активно участвовать в патриотической деятельности, так или иначе оказывая сопротивление нацистскому «новому порядку». Формы этого сопротивления были очень разнообразны. Целый ряд священнослужителей активно помогали партизанам. Используя свой сан и определённое доверие со стороны оккупантов, они собирали разведывательную информацию, участвовали в подготовке диверсий и т. п. Значительно большее количество предоставляли партизанам пищу, одежду, ночлег. Некоторые священники вели активную антифашистскую пропаганду и агитацию: произносили патриотические проповеди, распространяли в храмах послания митрополита Ленинградского Алексия и Патриаршего Местоблюстителя митрополита Сергия, советские газеты и листовки. Другие отказывались служить молебны в честь германской армии, призывая население сопротивляться насильственной эвакуации немцами…» Но были и другие факты. М. Шкаровский подчёркивает: «Помимо пропагандистских ведомств, органы германской контрразведки также активно пытались использовать священнослужителей в своих целях. Зная, что те подвергались перед войной жестоким гонениям, СД и Абвер рассчитывали, что они окажут им посильную помощь. На практике лишь относительно небольшая часть духовенства пошла на такое сотрудничество. После того как в Ленинградской области ряд священнослужителей отказался давать какую-либо информацию о своей общине Абверу, контрразведка там, по данным историка Н. А. Ломагина, «вскоре сочла более целесообразным вербовать агентуру в духовной среде из числа церковных старост, которые могли одновременно наблюдать как за священниками, так и за верующими. Певчие, дьяки также использовались в качестве агентов Абвера». Таким образом оккупанты пытались контролировать религиозную жизнь того или иного района».
Ярким примером тому служит деятельность Псковской Православной духовной Миссии (1941–1944 гг), которую сегодня некоторые историки оценивают как «успешную и очень эффективную». Однако без подробного изучения документов советских спецслужб такая оценка выглядит скорее надуманной, нежели близкой к истине. И вот почему.
Сама по себе организация «Православной Миссии в освобождённых областях России», в обиходе названной «Псковской Миссией» (по месту расположения своих руководящих органов), была создана с целью привлечения населения к сотрудничеству с немецкими оккупантами. Немудрено, что фашисты именно «через Церковь рассчитывали развернуть активную пропаганду против советской власти и привлечь на свою сторону симпатии верующих, пострадавших от антицерковных гонений в СССР».
«Как только фашисты заняли Ригу, немецкое командование нанесло визит митрополиту Виленскому и Литовскому Сергию (Воскресенскому), который, оставаясь в каноническом подчинении местоблюстителя патриаршего престола митрополита Сергия (Страгородского), тем не менее добровольно остался на оккупированной территории, — подчёркивает Сергей Пирумов. — Целью визита было — привлечь Православную Церковь к активной помощи немецкому командованию. Именно тогда и родилась идея о создании Миссии. Для её официального утверждения даже провели заседание самозваного «Синода», на котором присутствовали и представители немецкого командования. В результате 15 августа 1941 года «Русская Православная Миссия в освобождённых областях России» была учреждена. Сперва членами Миссии стали 16 священников и мирян. Впоследствии их число возросло почти до 200 человек.