В ходе подготовки к высадке на Британские острова (операция Seelöwe — «Морской лев») 168 танков Pz.III Ausf.F, G и Н и несколько командирских Pz.Bf.Wg. Ausf.E оснастили оборудованием подводного хода.
Все люки и щели в башне и корпусе загерметизировали с помощью разного рода резиновых прокладок и чехлов, а также битумной замазки. Воздух в танк подавался через резинотканевый рукав длиной 18 м и диаметром 200 мм. На внешнем конце рукава крепился поплавок, удерживавший его на поверхности воды. К этому же поплавку крепилась радиоантенна. Для откачки воды, которая могла бы поступать в танк, был установлен дополнительный откачивающий насос. При подводном движении двигатель танка охлаждался морской водой. Члены экипажа имели в своём распоряжении индивидуальные дыхательные средства, заимствованные у подводников. Переоборудованные таким образом танки, получившие название Tauchpanzer III, должны были доставляться к берегам Англии на специальных баржах и на 15-м глубине опускаться в воду с помощью крана. Для выдерживания направления движения под водой предназначался гирокомпас. Кроме того, корректировка направления могла осуществляться по радио с поверхности моря.
Из танков подводного хода Pz.III и Pz.IV и плавающих танков Pz.II сформировали 18-й танковый полк, развёрнутый в 1941 году в бригаду, а затем — в 18-ю танковую дивизию. Часть машин поступила на вооружение 6-го танкового полка 3-й танковой дивизии. Эти части проходили подготовку на полигоне Миловицы в Протекторате Чехии и Моравии. Поскольку высадка на берега «Туманного Альбиона» не состоялась, Tauchpanzer III перебросили на восток. В первые часы операции «Барбаросса» они по дну форсировали Западный Буг. В дальнейшем их использовали как обычные танки.
Схема движения Tauchpanzer III под водой.
Ещё раз применить эти машины по назначению планировалось при подготовке десантной операции на Мальту, но операция не состоялась.
К концу 1943 года началось интенсивное переоборудование линейных танков Pz.III в различные машины технической помощи.
Так, часть танков переоборудовали в БРЭМ Bergepanzer III. При этом вместо башни монтировался кран грузоподъёмностью до 1 т и деревянная грузовая платформа. Из штатного вооружения сохранялся только курсовой пулемёт MG 34. Прототип машины испытывался в марте 1944 года на Куммерсдорфском полигоне, после чего последовал заказ на 240 БРЭМ. Правда, с апреля 1944 по март 1945 года заводские цеха покинули только 176 машин этого типа. Они поступали, главным образом, в части самоходной артиллерии, вооружённые штурмовыми орудиями StuG III.
Одну БРЭМ оснастили специальным якорем больших размеров, с помощью которого она могла зацепиться за грунт. После этого установленной на ней лебёдкой можно было вытащить застрявшую технику массой до 15 т. Якорь перевозился за БРЭМ на специальном прицепе.
В 1943 году небольшое число Pz.III Ausf.L и М переоборудовали в инженерные машины. Башни снимались, а на их месте монтировалось различное оборудование и крепления для перевозки двух малых штурмовых мостов. Некоторое количество Pz.III ранних выпусков (модификации Е и G) переделали в подвозчики боеприпасов Munitionsschlepper III и артиллерийские тягачи.