— 8 управление
— Следчасть по особо важным делам
— ЦАУ
— ГУГК
— Контрольная инспекция
— Плановый отдел
— Финансовый отдел
— Главная бухгалтерия
— Секретариат ОСО
— Секретариат МВД СССР
— первый заместитель министра внутренних дел СССР И.А.Серов:
— 1, 2, 3, 6, 7 управления
— Тюремное управление
— 1, 3,4, 5 с/о
— Отдел "С"
— Комендатура МВД СССР
— первый заместитель министра внутренних дел СССР К.Ф.Лунев:
— 4,5,9,10,11 управления
— 2,6,7 с/о
— Отдел "П"
— заместитель министра внутренних дел СССР И.И.Масленников:
— ГУМ
— ГУПО
— УВС
— УС МПВО
— ВСУ
— ХОЗУ
— УУЗ
— Отдел по контролю и инспектированию ВОХР
— отдел перевозок
— заместитель министра внутренних дел СССР С.Н.Переверткин:
— ГУПВ
— ГУВО
— УКО
— Отдел "М"
— ОФС
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 1 сентября 1953 г. Особое совещание при МВД СССР было упразднено, а приказом МВД СССР № 00780 от 11 сентября 1953 г. Секретариат ОСО при МВД СССР был расформирован.
Приказом МВД СССР № 00802 от 17 сентября 1953 г. на базе 1 отдела 5 управления МВД СССР был организован 10 спецотдел МВД СССР (оперчекработа на объектах Министерства среднего машиностроения СССР). Этим же приказом исполняющим обязанности начальника 10 с/о МВД СССР был назначен бывший начальник 1 отдела 5 управления МВД СССР, а ранее бывший начальник отдела "К" МГБ СССР полковник А.М.Иванов. Штат 10 с/о МВД СССР — 80 человек.
Постановлением СМ СССР № 2632 от 8 октября 1953 г. и приказом МВД СССР № 00940 от 20 октября 1953 г. Главлит (11 главное управление) было выделено из состава МВД СССР в самостоятельное Главное управление при Совете Министров СССР.
24 ноября 1953 года МВД СССР направил в Президиум ЦК КПСС на имя Г.М.Маленкова и Н.С.Хрущева проект постановления ЦК КПСС "О сокращении штатной численности органов МВД и утверждении структуры МВД СССР". В указанном проекте постановления предлагалось упростить структуру МВД СССР, для чего:
— объединить 4 и 5 управления в одно управление: 4 управление МВД СССР;
— объединить 3 и 5 с/о в один: 5 с/о МВД СССР;
— упразднить 6 с/о с передачей его функций 4 управлению МВД СССР;
— упразднить УКО, передав его функции ГУВО, которое впредь именовать: ГУВКО МВД СССР;
— влить Главную бухгалтерию в Финансовый отдел МВД СССР.
Всего же предлагалось сократить штат Центрального аппарата МВД СССР на 20 %, закончив проведение организационных мероприятий к 1 февраля 1954 г.
Во исполнение постановления СМ СССР № 109-65сс от 21 января 1954 г. совместным приказом министра юстиции СССР и МВД СССР № 005/0041 от 28 января 1954 г. ГУЛАГ из ведения Министерства юстиции СССР был передан в ведение МВД СССР. Начальник ГУЛАГа МВД СССР — генерал-лейтенант И.И.Долгих, штат — 928 человек (в структуру ГУЛАГа Министерства юстиции СССР входило Управление детских колоний — бывший Отдел детских колоний МВД СССР до 5 марта 1953 г.).
Во исполнение постановления СМ СССР № 242-117с от 10 февраля 1954 г. совместным приказом Министерства лесной и бумажной промышленности СССР и МВД СССР № 26пс/092 от 13 февраля 1954 г. Главное специальное управление "Главспецлес" было передано из ведения Министерства лесной и бумажной промышленности СССР в ведение МВД СССР. Приказом МВД СССР № 00150 от 24 февраля 1954 г. Главспецлес был реорганизован в Главное управление лагерей лесной промышленности (ГУЛЛП) МВД СССР. Начальник ГУЛЛП МВД СССР — генерал-майор М.М.Тимофеев, штат — 128 человек.