В 1648 году началась осада Кандии (современный Ираклион). Предводитель турок Юсуф-паша яростно атаковал город во главе тридцати тысяч воинов; после того как два штурма были отбиты, он решил попытаться в третий раз со специально изготовленной большой стенобитной машиной. Турки рвались в крепость, Мочениго поспешил их встретить, готовый умереть в гуще врагов. Блестящая победа была вознаграждением за его героический поступок: враг был отброшен, а рвы заполнены мертвыми телами турок.
Турки могли быть изгнаны с Крита, если бы Венеция направила двадцать тысяч солдат в Кандию, но Европа оказала ей слабую поддержку, и Венеция призвала на действительную военную службу всех годных к войне, которую она могла вести.
Осада возобновилась некоторое время спустя, длилась дольше, чем осада Трои, и каждая кампания была отмечена новыми попытками со стороны турок оказать поддержку своей армии при победах в морских сражениях, достигнутых венецианцами. Последние продолжали наступательную тактику на море в Европе и, таким образом, явно превосходили мусульман, которые были вынуждены дорого платить за каждую попытку выхода из Дарданелл. Три человека фамилии Морозини и несколько – фамилии Мочениго прославились в этой продолжительной борьбе.
Наконец, прославленный Кёпрюлю, назначенный за свои заслуги великим визирем (1661) Османской империи, решил лично руководить (с 1666) этой войной, которая продолжалась так долго. Таким образом, он отправился на остров, на который транспортные суда высадили пятьдесят тысяч воинов, во главе которых он провел энергичную атаку (1667).
В этой незабываемой осаде турки проявили больше мастерства, чем до этого: их артиллерия очень тяжелого калибра обслуживалась хорошо, и впервые они использовали траншеи, которые были изобретением итальянского инженера.
Венецианцы со своей стороны значительно улучшили средства обороны за счет мин. Никогда еще не проявлялось такое упорство во взаимном уничтожении в сражениях, с помощью мин и штурмов. Героическое сопротивление позволило гарнизону продержаться в течение зимы; весной Венеция направила подкрепления, и герцог де ла Фейяд привел с собой несколько сот французских волонтеров.
Турки также получили сильные подкрепления и удвоили свои усилия. Осада подходила к концу, когда на помощь гарнизону пришли шесть тысяч французов под командованием герцога Бофора и Навелля (1669). Неудачно проведенная вылазка охладила пыл этих самонадеянных молодых людей, и Навелль, раздраженный бедствиями, сопутствовавшими осаде, взял на себя ответственность и по истечении двух месяцев вывез остатки своих войск назад во Францию. Морозини, у которого к тому времени было всего три тысячи измотанных солдат для защиты крепости, наконец, согласился оставить ее. Было достигнуто согласие о перемирии, за которым последовал формальный мирный договор. Кандия стоила туркам двадцати пяти лет усилий и более ста тысяч убитых (по другим данным 130 тысяч. – Ред.) в восемнадцати штурмах и нескольких сотнях вылазок. Подсчитано, что тридцать пять тысяч христиан различных национальностей погибли в увенчанной славой обороне этого места.