1) Федеральный дорожный фонд РФ;

2) Фонд развития таможенной системы РФ;

3) Межведомственный фонд развития налоговой системы и налоговой службы РФ;

4) Государственный фонд борьбы с преступностью;

5) Федеральный экологический фонд РФ;

6) Фонд контрольно—ревизионных органов Министерства финансов РФ;

7) Фонд по охране озера Байкал;

8) Федеральный фонд воспроизводства минерально—сырьевой базы;

9) Фонд управления, изучения, сохранения и воспроизводства водных биологических ресурсов;

10) Федеральный фонд восстановления и охраны водных объектов;

11) Фонд Министерства РФ по атомной энергии;

12) Фонд содействия военной реформе.