Учредитель управления вправе установить, что выгодоприобретателем по договору доверительного управления будет третье лицо. В таком случае порядок налогообложения участников договора изменится и будет осуществляться в соответствии с пунктом 4 статьи 276 НК РФ. Доходы, причитающиеся выгодоприобретателю, в налоговом учете отражаются как внереализационные. При определении величины налогооблагаемой прибыли выгодоприобретатель вправе уменьшить эти доходы на сумму расходов, связанных с исполнением договора доверительного управления. Выгодоприобретатель может включить во внереализационные расходы затраты доверительного управляющего только в том случае, если в договоре предусмотрена их компенсация за счет доходов, полученных от использования имущества, переданного в доверительное управление.

В состав внереализационных расходов выгодоприобретатель включает также вознаграждение, причитающееся доверительному управляющему. Однако сделать это можно, только если оно выплачивается за счет доходов, полученных в рамках исполнения договора доверительного управления.

Учредитель управления, не являющийся выгодоприобретателем по договору, может за счёт собственных средств выплачивать доверительному управляющему вознаграждение в фиксированной сумме. Такое вознаграждение не является расходом выгодоприобретателя. Не сможет его признать в налоговом учете также и учредитель доверительного управления поскольку при исчислении налоговой базы не учитываются расходы учредителя доверительного управления, связанные с исполнением договора, если в нем предусмотрено, что выгодоприобретатель не является учредителем. Дело в том, что расходами налогоплательщика признаются только те затраты, которые произведены для осуществления деятельности, направленной на получение дохода. Это означает, что отказавшийся от своего права на получение прибыли по договору доверительного управления учредитель не вправе уменьшать доходы, полученные по другим основаниям, на сумму расходов, которые произведены по этому договору. Причем в налоговом учете в состав расходов не включаются и суммы налога на имущество, а также транспортного налога, которые учредитель управления обязан уплачивать по имуществу, переданному в доверительное управление. Амортизация, начисляемая управляющим по объекту доверительного управления, также не уменьшает доходы учредителя управления, полученные им от других видов деятельности.

Убыток, полученный по договору доверительного управления, не учитывается в целях налогообложения ни у выгодоприобретателя, ни у учредителя управления.

Если учредитель управления является выгодоприобретателем, он исчисляет налог на прибыль по правилам, изложенным в пункте 3 статьи 276 НК РФ. На основании ежемесячно представляемых доверительным управляющим сведений о результатах его деятельности учредитель управления признает в налоговом учете доходы и расходы по доверительному управлению. Пунктом 4 статьи 1020 ГК РФ установлено, что доверительный управляющий обязан представить учредителю управления отчет. Сроки передачи отчета устанавливаются в договоре доверительного управления.