Получив серьезный отпор и не имея на тот момент еще четко оформленных силовых структур, кишиневские власти попытались перейти к тактике обезглавливания «сепаратистов» (а именно так предпочитали называть гагаузов и приднестровцев в Кишиневе): 30 апреля 1991 года спецслужбами Молдовы, созданными на базе республиканского управления КГБ СССР, были похищены председатель ВС ПМР Григорий Маракуца и 2 депутата — Вячеслав Заградский и Леонид Матейчук.

Похороны первых жертв конфликта в Дубоссарах 5 ноября 1990 года. Фото с сайта http://19iyunya1992.moy.su

23 августа были арестованы еще 5 депутатов, а через 5 дней в Киеве спецгруппа МВД Республики Молдова захватила лидера ПМР Игоря Смирнова и депутата Рыбнинцкого горсовета Андрея Чебана. Причем вначале Смирнову поступило сообщение от помощника президента Украины, что есть договоренность о встрече с Леонидом Кравчуком. Смирнову был даже забронирован номер в гостинице Верховного Совета Украины. И только после того, как лидера Приднестровья вывезли за пределы Украины, последовал протест со стороны МИД Украины.

В ответ на столь явную провокацию начались массовые выступления приднестровцев, подкрепленные организованной женщинами во главе с Галиной Андреевой и длившейся в течение месяца блокадой стратегически важной железнодорожной ветки «Одесса — Кишинев» (в Молдове эти события получили название «рельсовой войны»). В результате такого давления все задержанные руководители непризнанной республики были освобождены без всяких условий.

Мгновения так называемой рельсовой войны в Приднестровье. Фото с сайта http://19iyunya1992.moy.su

Весна и лето 1991 года прошли в напряжении. Обе стороны лихорадочно готовились к будущему столкновению. Так, 11 февраля 1991 года в Приднестровье создается сводный территориально-спасательный отряд подразделений Гражданской обороны. В тот же день состоялась учредительная конференция по возрождению казачества в Дубоссарском районе.

В Молдове продолжается националистическая истерия, сопровождающаяся фактическим вытеснением русскоязычного населения. Все, кто пытается хоть что-то делать, безжалостно наказываются. Ярким примером этого являются события 8 мая 1991 года, когда националистические боевики производят погром и поджог редакции газеты «Молодежь Молдавии».

Августовский путч 1991 года стал для Приднестровья, впрочем, как и для большинства «проблемных районов», неким водоразделом: 27 августа 1991 года Республика Молдова объявляет о своем выходе из состава СССР, в то же время руководство ПМССР (в лице председателя ОСТК и нескольких депутатов Верховного Совета ПМР) отправили в Москву телеграммы в поддержку «гэкачепистов».

«Под шумок» молдавские власти решили повторить прошлогодний захват г. Дубоссары. И снова было применено оружие против мирных жителей, снова пролилась кровь. На этот раз силы оказываются неравными, и молдавский ОМОН численностью до 400 человек 25 сентября захватывает города Дубоссары и Григориополь (будет выведен 1 октября 1991 года). Противостояние жителей захваченных городов и вооруженных сил республики подходит к опасной черте: так, в Дубоссары на помощь сторонникам ПМССР начинают массово прибывать добровольцы из других районов республики.