Эпизодически в качестве оппозиции справа ("системной оппозиции") выступала фракция "Яблоко", некоторые независимые депутаты (Владимир Рыжков), а также несколько депутатов от СПС (Сергей Ковалев, Юлий Рыбаков, Сергей Юшенков, Виктор Похмелкин, Владимир Головлев). Колебания между лояльностью и оппозиционностью иногда демонстрировал Б. Немцов - что, впрочем, проявлялось скорее в риторике, чем голосованиях. В Совете Федерации второго созыва в некоторой оппозиции к Путину находился только президент Чувашии Николай Федоров.
Президентские выборы
15 февраля 2000 года Путин был зарегистрирован Центризбиркомом кандидатом на пост президента. 18 февраля он посетил в качестве кандидата Иркутск, где поддержал идеи предлагавшегося Союзом правых сил референдума по четырем вопросам: о необходимости расширения гарантий защиты частной собственности; об ограничении депутатской неприкосновенности; о направлении в зоны вооруженных конфликтов только военнослужащих-контрактников; об ограничении права президента немотивированно отправлять в отставку правительство. В тот же день Путин одобрил идею "запретить секс, насилие и терроризм" на телевидении.
25 февраля было опубликовано "Открытое письмо Владимира Путина к российским избирателям". Через три дня на встрече в Москве со своими доверенными лицами Путин заявил, что "крайне важно создать равные условия для всех участников политической и экономической жизни России. Надо исключить то, чтобы кто-то присосался к власти и мог использовать это для своих целей. Ни один клан, ни один олигарх не должны быть приближены к региональной и к федеральной власти. Они должны быть равно удалены от власти и пользоваться равными возможностями".
На президентских выборах Путин был официально поддержан "Единством" Б. Грызлова - С. Шойгу, НДР Виктора Черномырдина, "Отечеством" Ю. Лужкова, объединением "Вся Россия" В. Яковлева - М. Шаймиева, движением "Народный депутат" Г. Райкова, "Союзом правых сил", "Аграрной партией России" (АПР) Михаила Лапшина и рядом других организаций. Особую и неоценимую поддержку Путину оказало Общественное российское телевидение Б. Березовского.
Плохо ориентировавшийся в избирательной кампании Путин обещал всем все, что мог. 2 марта на встрече с избирателями в Звездном городке он пообещал поддержать существование российской орбитальной станции "Мир", заверив, что "вопрос только в финансировании, и он будет решен" (через год избранный президент Путин санкционировал ликвидацию космической станции - она была утоплена 6 марта 2001 года). 5 марта в интервью телеканалу Би-Би-Си Путин, в тот момент обращавшийся к западному зрителю, заявил, что не исключает возможности вступления России в НАТО (чем вызвал недоумение многих российских политических деятелей и чиновников).
20 марта во время "рабочей поездки" в Чечню совершил широко освещавшийся в СМИ перелет на боевом истребителе Су-27 в качестве второго пилота-штурмана. Понятно, что этот цирковой номер был рассчитан на поднятие популярности Путина у простых избирателей. Но поскольку толкавшие Путина в президенты люди не объяснили, зачем посадили его в военный самолет, он, отвечая на вопросы американского телеведущего Теда Каппела, растерялся и пролепетал, что на военном самолете летел ради экономии государственных средств.